feat: add thesis document skeleton

.gitignore

@@ -22,9 +22,13 @@
 **/*.blg
 **/*.gz
 **/*.log
+**/*.lof
+**/*.lot
+**/*.toc
 **/*.out
 **/*.run.xml
 docs/proposal/*.pdf
+docs/thesis/*.pdf
 
 # Drawio backup and lock files
 **/*.drawio.bkp

docs/thesis/README.md

@@ -0,0 +1,17 @@
+# Thesis
+
+## Structure
+
+```
+I need to translate chapter names for my thesis from german into english. Translate the following chapter headings for me:
+- Einleitung
+- Gegenstand und Motivation
+- Problemstellung
+- Zielsetzung
+- Fragestellung
+- Gliederung der Arbeit
+- Grundlagen
+- Hauptteil
+- Implementierung/Reallisierung/Evaluation
+- Schlussbetrachtung (Trends, Entwicklung)
+```

docs/thesis/cover.tex

@@ -0,0 +1,28 @@
+\begin{titlepage}
+    \begin{center}
+        {\normalsize\textbf{Early detection of patient deterioration at home using smart medical sensors}} \\
+        \vspace{1cm}
+        \includegraphics[width=0.5\textwidth]{figures/tubs-logo.png} \\
+        \vspace{1cm}
+        {\large{Bachelor Thesis}} \\
+        \vspace{1cm}
+        {\small\textbf{
+            submitted to \\
+            Peter L. Reichertz Institut für Medizinische Informatik \\
+            der Technischen Universität Braunschweig \\
+            und der Medizinischen Hochschule Hannover \\
+            \vspace{0.5cm}
+            in September 2023 \\
+            \vspace{0.5cm}
+            by \\
+            Julian Lobbes \\
+            from Hannover
+        }} \\
+    \end{center}
+    \vfill
+    {\footnotesize{
+        Supervisor: Prof. Dr. Thomas M. Deserno \\
+        Supervising assistant: Prof. Dr. Sharareh R. Niakan Kalhori \\
+    }}
+\end{titlepage}
+%\newpage

docs/thesis/glossary.tex

@@ -0,0 +1,15 @@
+\makenoidxglossaries
+\newglossaryentry{dbms}{
+    type=\acronymtype,
+        name={DBMS},
+        description={Database Management System},
+        first={\Gls{dbms_full} (DBMS)}
+}
+\newglossaryentry{dbms_full}{
+    name={Database Management System},
+        description={
+            A Database Management System is a software system which enables the creation, organization, and management of databases.
+            It generally acts as an interface between the database and client applications, ensuring that data is consistently
+            stored and readily accessible in a secure and efficient manner, while maintaining data integrity.
+        }
+}

docs/thesis/thesis.tex

@@ -0,0 +1,174 @@
+\documentclass[12pt, a4paper]{article}
+
+\usepackage[utf8]{inputenc}
+\usepackage[T1]{fontenc}
+\usepackage{csquotes}
+\usepackage[english]{babel}
+\usepackage{graphicx}
+\usepackage{parskip}
+
+\usepackage[onehalfspacing]{setspace}
+\usepackage{geometry}
+\usepackage{titlesec}
+\usepackage{fancyhdr}
+
+\usepackage{color}
+\usepackage[colorlinks]{hyperref}
+\usepackage{tcolorbox}
+\tcbuselibrary{most}
+\pagestyle{plain}
+\usepackage[toc,nopostdot,nonumberlist,style=altlist,acronym]{glossaries}
+
+% Page margins
+\geometry{left=3cm, right=2cm, top=3cm, bottom=2cm}
+
+% Correct footnote size
+% TODO check if this is working correctly
+\renewcommand{\footnotesize}{\fontsize{10pt}{12pt}\selectfont}
+\usepackage[bottom]{footmisc}
+
+% Section Headings
+\titleformat*{\section}{\fontsize{16}{19}\selectfont\bfseries}
+\titleformat*{\subsection}{\fontsize{14}{17}\selectfont\bfseries}
+\titleformat*{\subsubsection}{\fontsize{12}{14.4}\selectfont\bfseries}
+
+% Page Numbering
+\pagestyle{fancy}
+\fancyhf{}
+\fancyhead[C]{\thepage} % Page number in header center
+\renewcommand{\headrulewidth}{0pt}
+\fancypagestyle{plain}{%
+  \fancyhf{} % clear all header and footer fields
+  \fancyhead[C]{\thepage} 
+}
+\setlength{\headheight}{14.49998pt}
+
+% Code listing
+\usepackage{listings}
+\definecolor{bgtinted}{HTML}{efefef}
+\definecolor{codegray}{HTML}{111111}
+\definecolor{codeorange}{HTML}{91632C}
+\definecolor{codegreen}{HTML}{3D5232}
+\definecolor{codepurple}{HTML}{4E3A52}
+\lstdefinestyle{mystyle}{
+    backgroundcolor=\color{black!5!white},
+    commentstyle=\color{codepurple},
+    keywordstyle=\color{codegray},
+    stringstyle=\color{codegreen},
+    basicstyle=\ttfamily\scriptsize\color{codegray},
+    breakatwhitespace=true,
+    breaklines=true,
+    captionpos=b,
+    keepspaces=true,
+    showspaces=false,
+    showstringspaces=false,
+    showtabs=false,
+    tabsize=2
+}
+\lstset{style=mystyle}
+
+% Citations
+%\usepackage{cite}
+\usepackage[backend=biber, style=vancouver]{biblatex}
+\addbibresource{../bibliography/bibliography.bib}
+
+% Colors
+\definecolor{PLRI_Rot}{RGB}{190,30,60}
+\definecolor{grau}{RGB}{120,110,100}
+
+% A command which generates a TODO message
+\newcommand{\todo}[1]{\fontfamily{lmtt}\selectfont{\color{orange}\small\underline{TODO:}} \textbf{#1}\fontfamily{lmss}\selectfont\normalsize \\}
+
+\input{./glossary.tex}
+
+\renewcommand{\thepage}{\Roman{page}}
+
+\begin{document}
+{\fontfamily{phv}\selectfont}
+
+\pagenumbering{Roman}
+
+\input{cover.tex}
+
+\section{Summary}
+
+\todo{Add: appendix, statement of eigenständigkeit.}
+
+Die Zusammenfassung sollte der Leitfaden der Ausarbeitung sein und einen kurzen Überblick 
+über die Ergebnisse geben. Eine maximal einseitige Zusammenfassung ist jeweils in 
+deutscher und englischer Sprache anzufertigen.
+
+\newpage
+\renewcommand*\contentsname{Table of contents}
+\tableofcontents
+
+\newpage
+\setcounter{page}{1}
+\pagenumbering{arabic}
+\section{Introduction}
+
+Die Struktur des Einleitungskapitels sollte sich an den einzelnen Stufen des 5-Stufen-Modells1 
+zur Vorgehensplanung orientieren. Zunächst beginnen Sie mit dem Abschnitt „Gegenstand 
+und Motivation“. In diesem Abschnitt sollen Sie:
+
+\begin{itemize}
+    \item{den Gegenstand Ihrer Arbeit beschreiben, }
+    \item{die Bedeutung Ihrer Arbeit für das Umfeld aufzeigen, }
+    \item{begründen, welche Problematik zur Erstellung der Arbeit geführt hat, sowie }
+    \item{die Motivation für die Erstellung dieser Arbeit erläutern. }
+\end{itemize}
+
+Die weiteren Stufen sind die Beschreibung der Problemstellung, die Zielsetzung der Arbeit 
+und die daraus resultierende Fragestellung sowie eine Gliederung ihrer Arbeit.
+
+\todo{write}
+
+
+\newpage
+\section{Background}
+
+\todo{write}
+
+
+\newpage
+\section{Main Section}
+
+\todo{write}
+
+
+\newpage
+\section{Implementation}
+
+\todo{write}
+
+
+\newpage
+\section{Evaluation}
+
+\todo{write}
+
+
+\newpage
+% TODO adjust: carry on from TOC
+\setcounter{page}{3}
+\pagenumbering{Roman}
+\printnoidxglossary[title=Glossary, toctitle=Glossary]\label{sec:glossary}
+\newpage
+\printnoidxglossary[type=\acronymtype, title=Acronyms, toctitle=Acronyms]\label{sec:acronyms}
+
+\newpage
+\listoffigures
+
+\newpage
+\listoftables
+
+\newpage
+\printbibliography
+
+% Appendix here
+
+\section{Ehrenwörtliche Erklärung}
+% Eigenständigkeitserklärung here
+\todo{write}
+
+\end{document}